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2025-06
| 收藏资源 | 描述 | 图片描述 |
|---|---|---|
| Bandicam | Bandicam（班迪录屏）是一款简单好用的电脑屏幕录制软件，也是一款可以高清流畅地录游戏，录视频的功能强大的录屏工具。 | |
| MCNP | MCNP®（蒙特卡洛 N-Particle®）代码可用于多种粒子的通用传输，包括中子、光子、电子、离子和许多其他基本粒子，最高可达 1 TeV/核子。 | |
| 位错的基本类型和特征 | 位错的基本类型和特征 | |
| lammps案例：Cu（111）表面能的 | lammps案例：Cu（111）表面能的 | |
| 天玑算-科研服务丨VASP教学（5）：表面能计算 | ~ | |
| 表面能计算 | How to calculate surface energy of a material using density functional theory | |
| Learn VASP | Learn VASP | |
| VASP: 差分电荷密度 | 计算差分电荷密度 | |
| 介电常数 | 介电常数计算 | |
| Materials Studio视频教程—电荷密度分析 | Materials Studio视频教程—电荷密度分析 | |
| The density profile tool for VMD | 用VMD计算密度分布、电荷分布 | |
| ELECTRODE | 用于原子模拟的电化学包 | |
| Scymol | 一个基于python的软件包，用于使用LAMMPS初始化和运行分子动力学模拟 |
2025-05
| 收藏资源 | 描述 | 图片描述 |
|---|---|---|
| ansys-spaceclaim-rve-multi-filler-particle–generator | Multi particle(filler) generator for Ansys DesignModeler or Spaceclaim | |
| LATEX table | Latex table 生成 | |
| Tables Generator | Latex table 生成 | |
| 录咖AI | ||
| edit | 微软开源的终端文本编辑器。 | |
| python-mastery | 高级Python精通（课程由@dabeaz） | |
| theme.park | 50个自托管应用程序的主题/皮肤集合！ | |
| PlotJuggler | 时间序列可视化工具 | |
| Git LFS | Git大文件存储（LFS）将音频样本、视频、数据集和图形等大文件替换为Git内的文本指针，同时将文件内容存储在远程服务器上，如GitHub.com或GitHub Enterprise。 | |
| LinuxMirrors | GNU/Linux 更换系统软件源脚本及 Docker 安装与换源脚本 |  |
| https://zhutix.com/ | 探索丰富多彩的主题、壁纸、图标、皮肤等酷炫的美化素材，个性化你的设备。 | |
| https://www.rainmeter.net/ | Rainmeter allows you to display customizable skins on your desktop, from hardware usage meters to fully functional audio visualizers. | |
| TranslucentTB | A lightweight utility that makes the Windows taskbar translucent/transparent. | |
| Windows 11、10 轻松设置 （1.10 正式版） | 一款为 Windows 11、Windows 10 系统设计的工具软件 | |
| hydrateflash | 这个代码实现了一套算法来求解水合物的热力学稳定性。 | |
| CCleaner | CCleaner 是一款方便、高效的工具，可帮助我的电脑维持流畅运行。 |  |
| ShellExView | Shell Extensions Manager |  |
| AutoPoly | 自动生成LAMMPS数据文件，用于原子和粗粒度模拟分子和聚合物材料的各种拓扑结构，即线性和环状 | |
| OPLSAA-foyer | Implementation of the OPLS-AA force field as a foyer force field | |
| CGAL | CGAL是一个开源软件项目，它以c++库的形式提供了对高效可靠几何算法的轻松访问。CGAL被用于各种需要几何计算的领域，如地理信息系统、计算机辅助设计、分子生物学、医学成像、计算机图形学和机器人。 | |
| pygalmesh | AI为你提供母语级高精翻译🕸️ A Python interface to CGAL’s meshing tools | |
| 中图分类法 | 我国建国后编制出版的一部具有代表性的大型综合性分类法 | |
| UDC分类 | 文献资料分类法 | |
| ENNUI | 一个优雅的神经网络用户界面，用于构建拖放式神经网络，在浏览器中进行训练，在训练期间进行可视化，并导出到Python。 | |
| nx-forum | NX Forum 是一个基于 Spring Boot + Nuxt 构建的现代化开源论坛系统。 | |
| Solo4A (Solo For All) | 旨在搭建独立开发者与用户沟通的桥梁，独立开发者可以在这里发布原创作品 | |
| flowerMD | Flexible Library of Organic Workflows and Extensible Recipes for Molecular Dynamics. |
2025-04
| 收藏资源 | 描述 | 图片描述 |
|---|---|---|
| https://mosdef.org/ | MoSDeF工具旨在促进原子和粗粒度系统配置的分层构建，经典力场（即原子分型）的应用，化学拓扑信息的封装，以及为各种分子动力学和蒙特卡罗模拟引擎（包括LAMMPS， GROMACS, HOOMD-Blue， Cassandra和GOMC）生成输入文件。 |  |
| the-book-of-secret-knowledge | 一个鼓舞人心的列表，手册，备忘单，博客，黑客，一行，cli/web工具和更多的集合。 | |
| https://lap.dev/lapce/ | 闪电般的快速和强大的代码编辑器 | |
| Deep-Live-Cam | 实时换脸和一键视频深度假只有一个单一的图像 | |
| MPhys | MPhys是一个标准化OpenMDAO中高保真多物理场问题的包。 | |
| best-of-atomistic-machine-learning | 🏆一个很棒的原子机器学习项目排名列表⚛️🧬💎。 | |
| https://cgenff.com/ | 您的解决方案自动拓扑生成和参数分配有机分子 | |
| ChemDoodle Web Components | A minimal, open-source, JavaScript library for fast, professional, HTML5 scientific interfaces | |
| 分子绘制 | ||
| https://water.lsbu.ac.uk/water/ | Water Structure and Science (was www.lsbu.ac.uk/water) | |
| typora-latex-theme | 将Typora伪装成LaTeX的中文样式主题，本科生轻量级课程论文撰写的好帮手。This is a theme disguising Typora into Chinese LaTeX style. | |
| SingleFile | Web Extension for saving a faithful copy of a complete web page in a single HTML file | |
| manim | Animation engine for explanatory math videos | |
| https://hidream.org/zh | HiDream-I1 是 HiDream-ai 开发的开源图像生成模型，具有 170 亿参数，性能卓越，适合研究及商业用途。 | |
| https://ohmyz.sh/ | Oh My Zsh is a delightful, open source, community-driven framework for managing your Zsh configuration. It comes bundled with thousands of helpful functions, helpers, plugins, themes, and a few things that make you shout… | |
| DearPyGui | Dear PyGui: A fast and powerful Graphical User Interface Toolkit for Python with minimal dependencies | |
| Theano | Theano是一个Python库，它允许您高效地定义、优化和计算涉及多维数组的数学表达式。 | |
| caffe | Caffe: a fast open framework for deep learning. | |
| VisPy | VisPy is a high-performance interactive 2D/3D data visualization library leveraging the computational power of modern Graphics Processing Units (GPUs) through the OpenGL library to display very large datasets. | |
| Vega-Altair | Vega-Altair is a declarative statistical visualization library for Python, based on Vega and Vega-Lite. | |
| Orange | 通过可视化编程或脚本进行数据挖掘、数据可视化、分析和机器学习。 | |
| EasyOCR | Ready-to-use OCR with 80+ supported languages and all popular writing scripts including Latin, Chinese, Arabic, Devanagari, Cyrillic and etc. | |
| indico | Indico - A feature-rich event management system, made @ CERN, the place where the Web was born. | |
| awesome-python | An opinionated list of awesome Python frameworks, libraries, software and resources. | |
| pyecharts-gallery | A Data Visualization Gallery Based on pyecharts. | |
| https://spdbv.unil.ch/ | DeepView 是一款用于可视化和分析蛋白质三维结构的免费软件。 | |
| GROMACS分子动力学教程 | GROMACS教程：漏斗网蜘蛛毒素肽的溶剂化研究 | |
| GROMACS分子动力学教程 | GROMACS分子动力学教程：水中溶菌酶的分子动力学模拟 | |
| GROMACS安装 | GROMACS安装 | |
| ParmEd | ParmEd是使用流行的分子模拟包（如用Python编写的Amber、CHARMM和OpenMM）帮助研究生物分子系统的通用工具。 | |
| foyer | Foyer 是一个基于 Python 的开源工具，可以使用 SMARTS 规则自动为分子自动分配 atom types 和力场参数，目前支持 GROMACS、LAMMPS 等格式输出。 | |
| openff-forcefields | OpenFF Initiative 致力于构建通用、开放式的有机小分子力场（如 Parsley 系列），附带有多个自动化工具用于参数拟合和分配。 | |
| CGenFF | CGenFF 是针对有机小分子（尤其是药物分子）设计的一套 CHARMM 力场；同时提供在线服务器及命令行工具，自动分配原子类型和参数。 | |
| SwissParam | SwissParam 是一个在线服务，专门为小分子生成与 CHARMM 力场兼容的参数和拓扑文件。 | |
| PRODRG (CCP4: Supported Program) | 一个经典在线服务器，用于从化学软件（如 ChemDraw）导出的结构生成分子拓扑和力场参数。 | |
| ATB | 一个在线平台，主要用于生成有机小分子的拓扑和力场参数，通常与 GROMOS 力场配合使用 | |
| Schrödinger Maestro/Desmond | 高性能分子动力学（MD）引擎，提供高可扩展性，吞吐量和科学准确性 | |
| structure2lammps | structure2lammps | |
| nanoHUB | nanoHUB 提供了一个在线工具，可根据结构文件生成适用于 LAMMPS 的数据文件，支持 Dreiding 或 PCFF 力场 | |
| XPB | XPB：用于高通量和高质量生成复杂聚合物结构的可扩展聚合物构建器点击复制文章链接，**eXtended_Coarse-Graining** | |
| MindSponge分子动力学模拟 | MindSponge分子动力学模拟合集 |
2025-03
| 收藏资源 | 描述 | 图片描述 |
|---|---|---|
| https://mp.weixin.qq.com/s/we5K_FCMA5tlKadi1YSrkw | Fluent 掺氢天然气管道泄露扩散过程仿真 | |
| https://meetily.zackriya.com/ | 开源的 AI 会议助手 | |
| ai-agents-for-beginners | 微软开源的 AI Agent 初学者教程 |  |
| https://github.com/beeware/toga | A Python native, OS native GUI toolkit. | |
| https://github.com/santinic/audiblez | 电子书转换为有声书 | |
| https://www.nordtheme.com/ | 北极蓝 配色方案 | |
| https://www.automl.org/hpo-overview/hpo-tools/hpo-packages/ | 贝叶斯超参数优化工具概述 | |
| uncle-novel | PC版全网小说下载器及阅读器 | |
| pumpkin-book | 《机器学习》（西瓜书）公式详解 | |
| https://github.com/o2oa/o2oa | 开源OA系统 | |
| cpufetch | Simple yet fancy CPU architecture fetching tool | |
| HyperLPR | High Performance Chinese License Plate Recognition Framework. | |
| https://cusdis.com/ | A lightweight, privacy-first, open-source comment system |  |
| https://www.drawio.com/ | 堪比Visio | |
| streamlit | Streamlit — A faster way to build and share data apps. |  |
| https://pwwang.github.io/cnn-convoluter/ | 展示卷积过程 | |
| https://www.zettlr.com/ | 一个Markdown编辑器 |  |
| https://www.showmeai.tech/tutorials/34 | 图解机器学习算法：从入门到精通系列教程 | |
| Story-Flicks | 一句话即可快速生成高清故事短视频，支持 DeepSeek 等模型 | |
| Video Subtitle Master | 批量为视频生成字幕，并可将字幕翻译成其它语言。 | |
| ImageGlass | 🏞一个轻量级，多功能的图像查看器 | |
| DeepSeek 实用集成 | AI为你提供母语级高精翻译DeepSeek 实用集成 | |
| https://abc.ufun.net/home | AI Tools |
2025-02
| 收藏资源 | 描述 | 图片描述 |
|---|---|---|
| https://eureqa.software.informer.com/ | Identify and compute mathematical formulas | |
| neurapress | NeuraPress Markdown 编辑器 | |
| https://www.chemtable.com/ | Maintenance and Optimization Tools for Windows | |
| https://cc-ats.github.io/mlp_tutorial/ | MLP Tutorial | |
| CompMatBook](https://github.com/stanfordbshan/CompMatBook) | 计算材料学 – 从算法原理到代码实现 | |
| https://www.carsi.edu.cn/ | 中国教育和科研计算机网联邦认证与资源共享基础设施（CERNET Authentication and Resource Sharing Infrastructure），简称CARSI | |
| https://chat.zju.edu.cn/ | 浙大满血deepseek | |
| https://www.cnblogs.com/BlogNetSpace/p/18265455 | 皮尔逊相关系数（Pearson Correlation Coefficient） | |
| https://ollama.com/ | Get up and running with large language models. | |
| readest | 电子书阅读器 | |
| ai.com | deepseek |
2025-01
| 收藏资源 | 描述 | 图片描述 |
|---|---|---|
| gpt-crawler | Crawl a site to generate knowledge files to create your own custom GPT from a URL | |
| ebook2audiobook | Convert ebooks to audiobooks with chapters and metadata using dynamic AI models and voice cloning. Supports 1,107+ languages! | |
| qwerty-learner | 为键盘工作者设计的单词记忆与英语肌肉记忆锻炼软件 / Words learning and English muscle memory training software designed for keyboard workers | |
| tabby | Self-hosted AI coding assistant | |
| https://github.com/XX-net/XX-Net | 这是一个稳健可靠的翻墙系统 | |
| https://xtxian.com/chatgpt/prompt/ | ChatGPT Prompt | |
| ChatGPT中文文档 | ChatGPT中文文档 | |
| https://blog.csdn.net/weixin_46417977/article/details/143808962 | ChatGPT学术专用版，一键润色纠错+中英互译+批量翻译PDF | |
| https://365.kdocs.cn/l/csgv1PX9egJp | 学术版GPT收集 | |
| 2025-Awesome-AI-Bloggers | 全网最全-2025年AI领域最值得关注的两百位博主和一手信息源盘点 | |
| https://simpletex.cn/ai/latex_ocr | 公式识别 | |
| https://two.avogadro.cc/ | A free and open source molecular editor and visualization tool. | |
| https://www.synopsys.com/manufacturing/quantumatk.html | QuantumATK - Atomistic Simulation Software | |
| ParmEd | Parameter/topology editor and molecular simulator | |
| DiffuseCode | Suite of programs to simulate disordered and nanomaterials | |
| https://www.diffpy.org/ | A free and open source software project to provide python software for diffraction analysis and the study of the atomic structure of materials. |  |
| https://enaloscloud.novamechanics.com/riskgone/nanoconstruct/ | NanoConstruct: Nanoparticle Construction Tool Powered by Enalos RiskGONE Cloud Platform | |
| https://nanocrystal.vi-seem.eu/ | A tool for the construction of spherical nanoparticles | |
| Crystallography tool | A crystallographic tool for the construction of nanoparticles | |
| https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.2c01029 | A Tool for Modeling and Engineering Functional Nanoparticles at a Coarse-Grained Resolution | |
| multiase | Multi-scale code | |
| aenet-lammps | Artificial Neural network (ANN) potential parameter file of BCC iron. | |
| mlmod | Machine learning package for data-driven modeling and simulation of particle systems, materials, and complex fluids (interfaces with LAMMPS MD package) | |
| Desmond Tutorial | This is the Maestro structure file of the entire membrane simulation system including OPLS-AA force field parameters. | |
| https://people.chem.ucsb.edu/kahn/kalju/chem126/public/modeling.html | Computational Chemistry Software in CCL | |
| mdgo | A codebase for classical molecular dynamics (MD) simulation setup and results analysis. |  |
| https://mdpow.readthedocs.io/en/latest/ | MDPOW is a python package that automates the calculation of solvation free energies via molecular dynamics (MD) simulations. In particular, it facilitates the computation of partition coeffcients. Currently implemented: |  |
| emc-pypi | Python interface for Enhanced Monte Carlo (EMC) | |
| pyopls | A Python 3 implementation of orthogonal projection to latent structures | |
| http://polypargen.com/ | PolyParGen provides OPLS-AA and Amber force field parameters for polymers or large molecules. | |
| https://www.cheminfo.org/Chemistry/Cheminformatics/FormatConverter/index.html | OpenBabel allows to convert nearly all the chemical formats and it very practical to quickly move from one program to another. | |
| https://cdb.ics.uci.edu/cgibin/BabelWeb.py | Babel: Molecule Format Converter | |
| https://www.qxlfzmn.com.cn/wdoc_25877697.html | LAMMPS讲解65-回转半径和扩散模拟 | |
| https://www.aatbio.com/tools/smiles-to-mol-converter | SMILES to MOL Converter | |
| http://biotech.fyicenter.com/1000068_JSME_SMILES_to_SDF_Mol_Online_Converter.html | SMILES to 2D or 3D SDF/Mol Converter | |
| https://www.rcsb.org/chemical-sketch | Chemical Sketch Tool |  |
| https://www.antvaset.com/smiles-to-structure | SMILES to Structure | |
| https://www.antvaset.com/ | This website is a repository of projects that I’ve created, with the topics ranging from healthcare and life sciences to linguistics and typography. |