2024年12月15日
LAMMPS
ch2lmp
[toc]
由chatGPT生成
教程:使用 CHARMM 工具生成 LAMMPS 输入文件工具背景charmm2lammps.pl 和 lammps2pdb.pl 是由 Pieter J. in ‘t Veld 和 Paul Crozier 创建的工具,用于将 CHARMM 力场参数转 ...
Read more
2024年10月21日
DeepMD
[toc]
DP-GEN (Deep Generator)是一个用Python编写的软件,精心设计用于生成基于原子间势能和力场的深度学习模型,依赖于DeepMD-kit。
下载并安装
Python >= 3.9
pip install
12conda activate ...
Read more
2024年10月10日
DeepMD
[toc]
小白,按教程写的,不一定对,但是,是一个完成的流程
数据准备执行VASP计算获取OUTCAR1234mkdir 00.datacd 00.datamkdir VASPcd VASP
创建VASP模拟输入数据
INCAR
123456789101112131415161 ...
Read more
2024年9月24日
DeepMD
DPTI
[toc]
将以气态甲烷分子为例,详细介绍Deep Potential (DP)模型的训练和应用。
手动安装cpu版123wget https://github.com/deepmodeling/deepmd-kit/releases/download/v3.0.0b3/deepmd-k ...
Read more
2024年9月12日
机器学习
[toc]
GBDT(Gradient Boosting Decision Tree)和GBR(Gradient Boosting Regression) 都属于梯度提升(Gradient Boosting)框架,但它们之间的区别主要体现在应用场景和具体模型结构上。以下是详细的对比分析:
1 ...
Read more
2024年7月1日
Paper Notes
Paper Notes 20242024-12月Light Gradient Boosting Machine (LightGBM) 是什么模型Light Gradient Boosting Machine (LightGBM) 是一种高效的梯度提升树(Gradient Boosting ...
Read more
2024年6月22日
Python
Tutorials
[toc]
单独画色棒12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npimport fa ...
Read more
2024年6月17日
Lammps
相图
[toc]
dCCI method
dynamic Clausius–Clapeyron integration (dCCI)
dCCI方法的优点在于,它使用相对较短的单次非平衡模拟,提供了跨越大范围热力学状态的共存曲线
安装配置环境Clone DCCI库到src文件12cd ./l ...
Read more
2024年6月4日
向日葵远程
向日葵远程远程连接键盘鼠标失控
问题描述
向日葵远程连接时,ctrl键或者其他键失控,导致滚动变成了缩放等问题。
解决方法:
(1)按住 Alt 键3秒左右松开,键盘就会恢复正常;
(2)Ctrl+Alt+Delete 启动任务管理器,键盘就会恢复正常;
参考:[1] 工具向日葵远程控制之后键盘失效、自动锁定按住Alt ...
Read more
2024年5月29日
PALABOS
LBM
[toc]
userInput主要读取参数代码位置123456palabos/examples/codesByTopic/userInput├── build├── CMakeLists.txt├── demo.xml├── readParameters.cpp└── tmp
代码分析12 ...
Read more