Eastsheng's Wiki

LAMMPS 中 fix wall/lj126 的使用示例

ChatGPT生成 LAMMPS wall/lj
[toc] ChatGPT生成 LAMMPS 中 fix wall/lj126 ,用于在模拟系统中引入 Lennard-Jones 12-6 型势能的硬壁(壁面势)。下面是对该命令的详细解释: 🧱 命令结构:1fix wall all wall/lj126 xlo EDGE 0.0 ...
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Alamode 计算Si导热

Alamode
测试环境:WSL2: Ubuntu 22.04 在此之前已获得:DFSET_harmonic cp si_alm.in to si_alm2.in,修改如下内容: 1234567891011121314&general PREFIX = si222_cubic MOD ...
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Notes-2025-A

Paper Notes
Notes 2025-A2025-09月Reduced order model是什么?Reduced Order Model(ROM,降阶模型)是一种数学建模和计算方法,主要用于在保持系统主要动力学或物理特性的前提下,简化复杂系统的计算过程。 换句话说: 全阶模型(Full Order M ...
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ch2lmp tool

LAMMPS ch2lmp
[toc] 由chatGPT生成 教程:使用 CHARMM 工具生成 LAMMPS 输入文件工具背景charmm2lammps.pl 和 lammps2pdb.pl 是由 Pieter J. in ‘t Veld 和 Paul Crozier 创建的工具,用于将 CHARMM 力场参数转 ...
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DP-GEN生成深度学习模型:methane

DeepMD DP-GEN
[toc] DP-GEN (Deep Generator)是一个用Python编写的软件,精心设计用于生成基于原子间势能和力场的深度学习模型,依赖于DeepMD-kit。 下载并安装 Python >= 3.9 pip install 12conda activate ...
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一个DeepMD完整例子:water

DeepMD
[toc] 小白,按教程写的,不一定对,但是,是一个完成的流程 数据准备执行VASP计算获取OUTCAR1234mkdir 00.datacd 00.datamkdir VASPcd VASP 创建VASP模拟输入数据 INCAR 123456789101112131415161 ...
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DeepMD 快速上手

DeepMD DPTI
[toc] 将以气态甲烷分子为例,详细介绍Deep Potential (DP)模型的训练和应用。 手动安装cpu版123wget https://github.com/deepmodeling/deepmd-kit/releases/download/v3.0.0b3/deepmd-k ...
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GPUMD安装与测试

GPUMD
[toc] WSL2 Ubuntu 22.04测试 安装1234567891011121314151617181920# 测试显卡nvidia-smi# 需要 CUDA Toolkit(nvcc)which nvccnvcc --version# 若没有,则安装sudo apt upda ...
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GPUMD NEP训练例子

GPUMD NEP
[toc] 输入文件准备 nep.in,指定用于训练NEP的超参数 12345678910111213type 2 Te Pb # number of atom types and list of chemical speciesversion 4 ...
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GBDT 和 GBR 的区别

机器学习
[toc] GBDT(Gradient Boosting Decision Tree)和GBR(Gradient Boosting Regression) 都属于梯度提升(Gradient Boosting)框架,但它们之间的区别主要体现在应用场景和具体模型结构上。以下是详细的对比分析: 1 ...
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